تم إنشاء جامعة مطروح استجابةً لطبيعة النهضة التعليمية التي تشهدها جمهورية مصر العربية، فلقد حرصت القيادة السياسية برئاسة السيد الرئيس عبد الفتاح السيسي على نشر العلم في ربوع البلاد. وتعد جامعة مطروح هي الجامعة رقم (26) على مستوى جامعات مصر، حيث صدر القرار رقم 1715 لسنة 2018 بإضافة جامعة مطروح إلى الجامعات المنصوص عليها، وذلك بعد صدور قرار رئيس مجلس الوزراء رقم (436) لسنة 2013، بإضافة فرع مرسى مطروح لجامعة الأسكندرية.
تتطلع جامعة مطروح إلى أن تكون من الجامعات الرائدة في مجال التعليم الجامعي والبحث العلمي على المستوى المحلي، العربي، الإفريقي، الدولي، والتميز بنوعية التعليم القائم على الإبداع والابتكار في كافة مجالات العلوم التطبيقية والإنسانية.
تتحدد رسالة جامعة مطروح في التطوير المستمر في استراتيجيات ومخرجات التعليم والتعلم، واستثمار خصوصية إقليم مطروح؛ لتقديم فرص تعليمية وبحثية وتدريبية محورها الطالب وفقًا لمعايير الجودة الشاملة، من أجل تخريج كوادر بشرية متميزة منافسة ذات مهارات متعددة، قادرة على تلبية متطلبات سوق العمل، تدعيم البحث العلمي الهادف، تحقيق التنمية المستدامة لخدمة المجتمع، وحماية البيئة الصحراوية والبحرية.